Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Foxd3Q61060 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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