Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ift20Q61025 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms