Protein–RNA interactions for Protein: Q60739

Bag1, BAG family molecular chaperone regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bag1Q60739 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bag1Q60739 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bag1Q60739 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms