Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sik1Q60670 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms