Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PkdccQ5RJI4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PkdccQ5RJI4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms