Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa23Q5G866 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Defa23Q5G866 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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