Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nlrc3Q5DU56 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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