Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fam208bQ5DTT3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms