Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trp53i11Q4QQM4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trp53i11Q4QQM4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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