Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Syne3Q4FZC9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms