Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933416C03RikQ3V063 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms