Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn13Q3UW68 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms