Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnga4Q3UW12 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cnga4Q3UW12 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cnga4Q3UW12 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnga4Q3UW12 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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