Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chpf2Q3UU43 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chpf2Q3UU43 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms