Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms