Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hdgfl2Q3UMU9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdgfl2Q3UMU9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdgfl2Q3UMU9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hdgfl2Q3UMU9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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