Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms