Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms