Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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