Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms