Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nlrx1Q3TL44 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrx1Q3TL44 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrx1Q3TL44 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms