Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samd11Q1RNF8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Samd11Q1RNF8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Samd11Q1RNF8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Samd11Q1RNF8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Samd11Q1RNF8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd11Q1RNF8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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