Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Traf3ip1Q149C2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Traf3ip1Q149C2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms