Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc162pQ0VG85 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms