Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms