Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms