Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rad51Q08297 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rad51Q08297 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms