Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MestQ07646 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MestQ07646 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MestQ07646 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms