Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms