Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sh3bp2Q06649 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sh3bp2Q06649 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bp2Q06649 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh3bp2Q06649 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Sh3bp2Q06649 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms