Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPINDOCQ05AH6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms