Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoc2Q05020 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms