Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms