Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smarcad1Q04692 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms