Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Muc1Q02496 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms