Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cacna1cQ01815 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms