Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec23aQ01405 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms