Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb5P99024 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms