Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cfc1P97766 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms