Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig3P97386 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms