Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg1P97376 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg1P97376 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg1P97376 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg1P97376 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg1P97376 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frg1P97376 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frg1P97376 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Frg1P97376 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg1P97376 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg1P97376 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg1P97376 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg1P97376 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg1P97376 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms