Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nucb2P81117 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nucb2P81117 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms