Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx3P81067 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx3P81067 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms