Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx2P81066 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irx2P81066 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms