Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb1P70662 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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