Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msx3P70354 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx3P70354 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx3P70354 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx3P70354 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx3P70354 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms