Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsnl1P62761 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms