Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f4P62515 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms