Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Polr2iP60898 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Polr2iP60898 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr2iP60898 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms