Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd4P58467 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms